Информация о статье

2000 г., Том 5, Спец. выпуск, с.87-99

Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г., Ватолин Ю.Н., Бажан С.И.

Обобщенный химико-кинетический метод моделирования сложных биологических систем. Компьютерная модель онтогенеза бактериофага Lambda

Предложен обобщенный химико-кинетический метод моделирования, основанный на блочном принципе описания динамики функционирования биологических систем произвольной сложности в терминах элементарных процессов. Разработан алгоритм конструирования моделей сложной молекулярно-генетической системы из отдельных блоков, описывающих элементарные процессы. В рамках обобщенного метода построена динамическая модель онтогенеза фага [Java Applet] в клетке E.coli. В рамках модели описаны процессы репликации в [Java Applet]- и [Java Applet]-формах, транскрипция генов и трансляция мРНК, функции промоторов [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet] конститутивного терминатора [Java Applet], Q-регулируемого [Java Applet]-независимого терминатора транскрипции [Java Applet] и N-регулируемых [Java Applet]-зависимых терминаторов транскрипции [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet]-сайтов, а также функции белков exo, xis, beta, gamma, N, cI ([Java Applet]-repressor), cII, cIII, cro (tof, antirepressor), O, P, Q, S, R, контролирующих все основные этапы реализации генетической программы развития фага в клетке. Предложенный алгоритм конструирования моделей из подмоделей "генов" по заданной "генетической" карте позволяет рассчитывать динамику функционирования практически любого генетического варианта, который можно сконструировать из генов фага [Java Applet].


Библиографическая ссылка:
Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г., Ватолин Ю.Н., Бажан С.И. Обобщенный химико-кинетический метод моделирования сложных биологических систем. Компьютерная модель онтогенеза бактериофага Lambda // Вычислительные технологии. 2000. Т. 5. Специальный выпуск, посвященный 10-летней годовщине Лаборатории теоретической генетики Института цитологии и генетики СО РАН. С. 87-99
Главная| Цели| Редколлегия| Содержание| Поиск| Подписка| Правила| Контакты
ISSN 1560-7534
© 2024 ФИЦ ИВТ, Новосибирск