|
Информация о статье
2000 г., Том 5, Спец. выпуск, с.32-40
Колчанов Н.А., Подколодный Н.Л., Ананко Е.А., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Меркулова Т.И., Горячковская Т.Н., Степаненко И.Л., Кель А.Э., Кель-Маргулис О.В., Наумочкин А.Н., Григорович Д.А., Лохова И.В., Ромащенко А.Г.
Новые возможности базы данных по регуляторным районам транскрипции эукариот (TRRD)
Излагаются возможности новой версии базы данных (БД) TRRD 4.2, содержащей описание более 850 генов, свыше 3800 вариантов их экспрессии, около 1200 регуляторных единиц и более 4000 сайтов связывания транскрипционных факторов. Информация собрана на основе реферирования около 2800 научных публикаций. База данных TRRD установлена под SRS (Sequence Retrieval System), что обеспечивает возможность гибкой и эффективной генерации интерактивных запросов, а также интеграцию с другими БД. Информация размещена в пяти взаимосвязанных таблицах, в которых содержатся сведения о генах, структуре их регуляторных районов, особенностях экспрессии, а также данные о сайтах связывания транскрипционных факторов и их характеристики.
Библиографическая ссылка:
Колчанов Н.А., Подколодный Н.Л., Ананко Е.А., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Меркулова Т.И., Горячковская Т.Н., Степаненко И.Л., Кель А.Э., Кель-Маргулис О.В., Наумочкин А.Н., Григорович Д.А., Лохова И.В., Ромащенко А.Г. Новые возможности базы данных по регуляторным районам транскрипции эукариот (TRRD) // Вычислительные технологии. 2000. Т. 5. Специальный выпуск, посвященный 10-летней годовщине Лаборатории теоретической генетики Института цитологии и генетики СО РАН. С. 32-40
|
