2000 г., Том 5, Спец. выпуск, с.25-31

Создан метод для распознавания ТФ-композиционных модулей (комбинаций сайтов связывания транскрипционных факторов) в промоторах генов, имеющих сходную регуляцию экспрессии. Такие ТФ-композиционные модули могут служить комбинаторными мишенями для комплексов различных транскрипционных факторов, синергично активирующих транскрипцию этих генов. Проанализированы промоторы генов клеточного цикла, имеющие максимальный уровень экспрессии при G1/S-переходе и в S-фазе. Выявлены E2F-композиционные модули, состоящие из E2F-сайтов, аранжированных дополнительными олигонуклеотидами, содержащими SCG-, TTT- и WW-мотивы. В проанализированных промоторах генов клеточного цикла композиционные модули показали исключительно высокую концентрацию и специфическое расположение вблизи старта транскрипции. Поиск таких композиционных модулей в геномных последовательностях дает возможность предсказания новых генов клеточного цикла и позволяет более полно описать сложную сеть генной регуляции, контролирующую клеточную пролиферацию, дифференцировку и апоптозис. Соответствующие электронные ресурсы размещены по адресу: http://compel.bionet.nsc.ru/FunSite/SiteScan.html.